Desde novembro de 2018 como jogador do Palmeiras apesar de ainda estar no Bahia, o meia Zé Rafael era visto como promissor no esquema tático de Felipão, uma vez que, além de Dudu, não havia outras opções para o setor da ponta no meio-campo.
Ainda com o esquema 4-2-3-1, o camisa 8 era visto como um atleta que ajudaria a realizar a transição de jogo para o ataque. Seu desempenho no clube de Salvador o credenciava a brigar pela titularidade no alviverde.
No entanto, apesar dos pedidos da torcida, Zé Rafael tem sido preterido na equipe e outros jogadores que chegaram depois, como Carlos Eduardo e Felipe Pires, além de Gustavo Scarpa, já conhecido no clube. Por enquanto, ele disputou apenas a partida contra o Botafogo de Ribeirão Preto, no dia 23 de janeiro, válida pela segunda rodada do Campeonato Paulista e que teve elenco misto.
Apesar de ser relacionado para todos os outros oito compromissos desde então, ele não tem recebido chances na equipe e a situação tem causado estranheza para quem vê de fora. Felipão se pronuciou na sétima rodada do Paulistão de maneira irritada, após o empate em 0 a 0 contra a Ferroviária. Mesmo com a falta de criação dos jogadores, ele se mostrou irredutível a dar mais chances ao reforço.
Os R$ 14,3 milhões desembolsados por ele não têm pesado na decisão de colocar o atleta em campo, muito menos a reclamação dos fãs palmeirenses. A preferência do treinador por Dudu, Carlos Eduardo, Felipe Pires e até Hyoran, recuperado recentemente de lesão, não o ajudam nessa questão.
Mais recentemente, antes da partida contra o Junior Barranquilla pela Copa Libertadores, o técnico voltou a falar sobre o meia. Desta vez, com tom mais detalhado, Felipão explicou o motivo da ausência do meio-campista nos onze iniciais.
"O Zé Rafael teve poucas chances porque eu entendo que na posição que ele joga, que é o lado esquerdo, tem o Dudu. E o Dudu tem dado conta. E no momento que eu acho interessante vou colocá-lo. Ele tem treinado normalmente", revelou.
Considerando a situação, o Vasco da Gama colocou em pauta a possibilidade de obter Zé Rafael por empréstimo, mas o Palmeiras recusou a investida dos cariocas. Seu futuro na equipe parece fadado a aguardar uma oportunidade por conta da ausência do camisa 7, algo que deve ocorrer apenas em caso de lesão ou por ser poupado, o que não aconteceu em nenhum dos 10 compromissos da equipe na temporada.