Esteve três épocas ligado ao Belenenses, mas essa ligação chegou, amargamente, ao fim. Fábio Nunes foi dispensado por Domingos Paciência nesta janela de mercado, e acabou por encontrar clube na liga grega, onde irá vestir a camisola do Kerkyra, 10º classificado da última edição da liga local.
Depois de uma temporada em que começou cedido ao Tondela, mas regressou em janeiro à casa mãe, o canhoto de 25 anos (que tanto pode jogar a lateral como a extremo) completando a época 2016/17 com 16 jogos realizados.
Agora, segundo o portal 'Maisfutebol', Fábio vai assinar por duas épocas com os gregos do Kerkyra, regressando assim ao estrangeiro, onde já esteve, no Parma e no Blackburn Rovers.